商用主板目前主要采用ATX架構，工業工控主板為了適應多種應用環境，采用集成度高，體積小，多種尺寸規格的主板，包括3寸板、5寸板、ATX、Micro-ATX、LPX、半長卡、全長卡等各種規格。另外，由于工業工控主板價格較高，部分商家用商用主板的材料做成工業工控主板的規格，以賺取更大的利潤空間。

　　另外，商用主板，往往只能提供4根PCI插槽，由于受制于PCI 規范，基本上PCI 4的驅動能力有相當大的衰減，因此大多數商用主板僅提供3根PCI槽;

　　工業工控主板，由于其設計用料的工業性，除支持PCI插槽外，同時可以支持Mini PCI-E、PC 104+ 、COM口等接口，內嵌GPIO總線，可以實現GPI，GPO功能，而且工業半長卡、全場卡能與底板配合更具擴展性支持多個ISA、PCI、MINIPCI擴展。

　　當然3寸、5寸等嵌入式的主板是屬于定制類的規格，其擴展性就不會考慮太多。 6.使用環境：

　　工業工控主板常在惡劣環境下工作(壽命期內永久開機、氣候惡劣、潮濕、振動、多塵、輻射、高溫等等)，而這些環境下是商用主板無法勝任，當今商業主板大部分只能運行在安定的環境下(工作時間短、室內、常溫等等)。